La colección de anfibios cuenta con registros de todos los departamentos de la Amazonia; actualmente los departamentos con el mayor número de registros son Amazonas, Caquetá y Vaupés, les siguen Guainía, Guaviare y Vichada, mientras que los departamentos de Putumayo y sur del Meta cuentan con un número menor de especímenes. La colección cuenta con especies de todos los órdenes: Anura, Caudata y Gymnophiona y aloja 8792 especímenes distribuidos en 195 especies, 16 familias y 53 géneros.
