La colección de reptiles cuenta con registros de todos los departamentos de la Amazonia, excepto las zonas orientales de Cauca y Nariño; los departamentos de Amazonas, Caquetá, Vaupés, Guainía y el Guaviare tienen por ahora el mayor número de registros, le siguen sur del Vichada y Putumayo, mientras que el sur del Meta cuenta con un número menor de especímenes. La colección aloja actualmente 3466 especímenes, los cuales representan 185 especies, 24 familias y 98 géneros y, cuenta con especies de todos los órdenes: Testudinia, Crocodilia, y Squamata, en este último se encuentran los subórdenes Amphisbaenia, Serpentes y Lacertilia.
