La colección de reptiles cuenta con registros de todos los departamentos de la Amazonia, excepto la zona oriental del departamento de Nariño; los departamentos de Amazonas, Caquetá, Vaupés, Guainía y Guaviare tienen por ahora el mayor número de registros, le siguen Putumayo y sur del Meta, mientras que Sur del Vichada y la Bota caucana cuenta con un número menor de especímenes. La colección aloja actualmente 5053 especímenes, los cuales representan 206 especies, 25 familias y 99 géneros y, cuenta con especies de todos los órdenes: Testudines, Crocodylia, y Squamata, en este último se encuentran los subórdenes Amphisbaenia, Serpentes y Lacertilia.
