La colección cuenta con 80 lotes de especies amenazadas, incluidas en la categoría Vulnerable de la Resolución 0126 de 2024.
Esta vulnerabilidad está asociada al uso dado a las especies, como peces ornamentales o para consumo nacional (más información en: https://www.sinchi.org.co/ciacol/indicador-de-captura-de-peces-comerciales-en-amazonia-por-debajo-de-las-tallas-reglamentarias)